血清是血液凝固后析出的液体，不含纤维蛋白原和部分凝血因子；血浆是抗凝全血离心后的上清，保留了纤维蛋白原和全部抗凝剂。两者在多数小分子检测中差异不大，但在细胞因子、酶类、激素检测中差异显著。
测IL-6、IL-1β、TNF-α这类细胞因子时，强烈推荐EDTA抗凝血浆。凝血激活过程中血小板α颗粒释放PDGF、TGF-β、IL-1β等介质，使血清结果比真实血浆水平偏高。文献报道血清IL-6可比血浆高20%-60%，具体程度与凝血时间和温度相关。
EDTA浓度过高（超过2mg/mL全血）会螯合二价金属离子，影响酶联反应中HRP活性。市售EDTA-K2采血管（紫色帽）一般含1.8mg/mL，刚好在安全范围内。采血后必须充分颠倒混匀8-10次，避免微凝块堵塞洗板机。
肝素抗凝血浆适用于测补体、环磷酸腺苷等指标，但肝素带负电，可能与带正电的检测抗体形成复合物，导致背景升高。若必须使用肝素，建议做平行验证：同一动物同时留EDTA血浆和肝素血浆，确认偏差小于15%再批量使用。
血清样本的优势在于不引入抗凝剂干扰，适合检测那些受EDTA抑制的金属蛋白酶活性。但血清制备需要室温凝血30-60分钟，此期间细胞因子仍在释放，因此血清结果更接近"凝血应激态"，不能直接与血浆数据互认。论文中必须明确写明样本类型，审稿人对这一点越来越敏感。